En 1880, Ernest de Blignières entreprend une ambitieuse rénovation du Vieux Bot pour y abriter sa remarquable collection d'objets d'art arabes, constituée lors de son séjour en Égypte où il servait comme contrôleur de la dette égyptienne. L'architecte Maigné conçoit les plans dès 1877, reproduisant le parti architectural initial tout en rehaussant l'édifice d'un étage supplémentaire. Le bâtiment conserve sa silhouette caractéristique : un corps de logis allongé flanqué de deux ailes perpendiculaires côté sud. L'architecte Ambroise Baudry prend ensuite en charge l'aménagement intérieur et confère aux pièces de réception un décor orientalisant raffiné, enrichi d'éléments architecturaux récupérés lors de démolitions d'anciens édifices égyptiens. L'ensemble est achevé en 1883, témoignant d'une entreprise de restauration particulièrement originale pour l'époque.