Fondée en 1090 par un gentilhomme dauphinois, la commanderie de Saint-Antoine devient au 12e siècle l'une des premières annexes languedociennes de l'ordre des Antonins, établi à Toulouse. Installée sur la route entre Lectoure et Agen, elle accueille un hôpital destiné aux malades et aux nécessiteux, ainsi qu'une chapelle dont subsiste la porte romane d'origine. Au 13e siècle, les donations permettent de reconstruire l'église et d'agrandir l'hôpital. Le bourg s'entoure alors de fortifications, fossés, ponts-levis et portes défendues. L'hôpital périclite progressivement au 17e siècle. En 1776, la suppression de l'ordre par le pape Pie VI transfère ses biens aux Chevaliers de Malte. À la Révolution, le site devient bien national et l'hôpital disparaît.